قرارداد نخستین توماس مولر در سال ۲۰۱۳ با بایرن مونیخ تمام می‌شد. درخشش بی‌نظیر او در جام جهانی ۲۰۱۰ آفریقای جنوبی اما خیلی زود ثمر داد و بهترین گلزن این جام قرارداد خود را روز جمعه (۶ اوت / ۱5 مرداد) با شرایط بسیار بهتری تا ۳۰ ژوئن ۲۰۱۵ تمدید کرد.
به گزارش دویچه‌وله، مولر در نخستین فصل حضور در تیم اصلی بایرن، هم جام قهرمانی لیگ برتر را تصاحب کرد و هم جام حذفی را. نایب‌قهرمانی چمپیونزلیگ با شکست ۲ بر 0 در برابر اینترمیلان ایتالیا هم دستاورد دیگر این تیم بود. او در جام جهانی ۲۰۱۰ با ۸ بازی ملی ۵ گل به ثمر رساند و به‌عنوان بهترین گلزن جام و بهترین بازیکن جوان این تورنمنت برگزیده شد.
کارل هاینتس رومنیگه، رئیس هیئت مدیره باشگاه بایرن مونیخ گفت: «بایرن ارزش توانایی بازیکنان را می‌داند. توانایی‌های مولر در فصل گذشته فوق‌العاده بود. او در فصل یادشده به همراه تیم موجب خشنودی هواداران بایرن شد و ما خوشحالیم که او در سال‌های آینده هم با این باشگاه همراه است.»
مولر نیز پس از تمدید قرارداد گفت: «بایرن وطن من و بایرن مونیخ باشگاه من است. خوشحالم که در ۵ سال آینده می‌توانم پیراهن این تیم را بر تن کنم.»
این پیراهن ظاهرا برای مولر ۲۲ ساله، هر سال ۳ میلیون یورو درآمد در بر خواهد داشت.