در ابتدای این دیدار 3 ساعته، 14 نفر از استادان، بیش از 2 ساعت دیدگاه‌های خود را درباره مسائل مختلف علمی، فرهنگی، اجتماعی، اقتصادی و سیاسی بیان کردند.پس از سخنان نمایندگان جامعه علمی- دانشگاهی، رهبر معظم انقلاب اسلامی با اشاره به اهمیت فراوان دانشگاه در عزت و اقتدار ایران، تأکید کردند: کشور نیازمند جهاد علمی در همه رشته‌ها و عرصه هاست و اینجانب با دقت و وسواس و دلواپسی این مسئله بسیار مهم را دنبال خواهم کرد.
ایشان با اشاره به موانع و معارضه‌های موجود برسر راه پیشرفت علمی کشور افزودند: در فرهنگ اسلامی، معنای جهاد در هر عرصه‌ای تلاش برای در هم شکستن موانع و معارضه‌هاست و از این نگاه اسلامی، کشور حقیقتاً نیازمند جهاد علمی است.
حضــرت آیت‌الله خامنــــه‌ای، انحصارگرایی و خست کشورهای پیشرفته علمی را در عرضه دانش و امکانات علمی از جمله موانع موجود در راه شکوفایی علمی کشور دانستند و خاطرنشان کردند: باید با جوشش درونی بر این مانع غلبه کنیم.
رهبر معظم انقلاب اسلامی برخورداری ملت ایران از پیشینه پرافتخار علمی- فرهنگی و هوش و استعداد ایرانیان را زمینه‌های مساعدی برای دستیابی به قله‌های رفیع علم و دانش برشمردند و افزودند: انقلاب اسلامی، احساس بیداری و توانایی را نیز به مجموعه عوامل تعیین‌کننده پیشرفت علمی کشور افزوده است.
ایشان، پیشرفت‌های تحسین‌برانگیز کشور را در زمینه‌های مختلف علمی- فناوری، نشانه توانایی مردم ایران در برداشتن گام‌های بلندتر خواندند و افزودند: همه پیشرفت‌های 30 سال اخیر را قدم‌های اول راه پرفروغ پیشرفت علمی کشور بدانیم و با نگاه راهبردی، به قدم‌های بلندتر فکر کنیم.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، سخنان استادان دانشگاه‌ها در این دیدار را بسیار خرسندکننده، متنوع، پرنکته و حاوی پیشنهادهای اجرایی برشمردند و افزودند: ایده جدید دانشگاه حکمت بنیان، پیشنهاد تشکیل رصدخانه پیشرفت نقشه جامع علمی کشور و تأکید بر اهمیت علوم انسانی از زوایای مختلف، از جمله نکات مهمی بود که اندیشمندان محترم بیان کردند.
رهبر معظم انقلاب اسلامی، انتقاد یکی از استادان درباره قدیمی بودن و تغییر نکردن سرفصل‌های علوم انسانی را ایرادی وارد دانستند و خاطرنشان کردند: این عیب، نشان دهنده نبود جرئت برای ورود به مناقشه فکری است که باید بالیبرال دمکراسی غربی وجود داشته باشد.
ایشان بیان پاسخ‌های مستدل اسلامی را درباره مسائل مطرح در علوم انسانی، روش صحیح مناقشه با علوم انسانی غربی دانستند و افزودند: استادان حوزه و دانشگاه‌ها باید با شجاعت در این میدان حضور یابند و مسئولیت سنگین خود را در تدوین پاسخ‌های رهگشای اسلام ایفا کنند.
رهبر معظم انقلاب اسلامی همچنین با اشاره به پیشنهاد یکی از استادان زن درباره ضرورت ارتباط بیشتر رهبری با جامعه زنان افزودند: جامعه زنان نیمی از جمعیت کشور را تشکیل می‌دهد و طبعاً با یک سازمان یا مجموعه قابل مقایسه نیست اما اساس این پیشنهاد صحیح است و باید ساز و کاری برای اطلاع از دیدگاه‌های زنان دانشمند فرزانه و تحصیل‌کرده کشور پیش‌بینی شود.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، سخنان یکی دیگر از استادان دانشگاه‌ها را درباره پیشرفت‌های افتخارآمیز ایران در عرصه‌های پزشکی مورد اشاره قرار دادند و افزودند: پیشرفت در عرصه‌ها و علوم دیگر نیز کاملاً چشمگیر است اما عده‌ای مدام در گوشه و کنار آیه یأس می‌خوانند و برای ناامید کردن مردم و دانشجویان و دانشگاهیان تلاش می‌کنند.
ایشان، اینگونه افراد را موریانه های مخرب و ویرانگر خواندند و خاطرنشان کردند: طبعاً حرکت عظیم ملت ایران، مانند هر حرکت اجتماعی تاریخی با چالش‌هایی روبه‌روست اما نهال انقلاب اسلامی امروز به شجره طیبه‌ای تبدیل شده و ایران، با طراوت تمام در حال رشد و پیشرفت است.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، تولید فکر را بسیار مهم و حتی دشوارتر از تولید علم دانستند و افزودند: ایران مهد فلسفه است و لازم است استادان حوزه‌ها و دانشگاه‌ها، در زمینه تولید فکرِ منبعث از نگاه فلسفی تلاش کنند.رهبر معظم انقلاب اسلامی، با اشاره به مراحل نهایی تصویب نقشه جامع علمی کشور تأکید کردند: این نقشه، به برنامه اجرایی نیاز دارد و مسئولان دستگاه‌های ذیربط برای تحقق نقشه جامع علمی، برنامه‌ای دقیق تدوین کنند.
ایشان التزام همه مراکز علمی- تحقیقاتی به نقشه جامع علمی را ضروری خواندند و افزودند: نقشه جامع علمی، زنده و پویا و به روز باشد و بر اجرای دقیق آن نظارت شود.رهبر معظم انقلاب اسلامی همچنین توسعه غیرهدفمند آموزش عالی را موجب اتلاف بودجه و نیروی انسانی خواندند و افزودند: نیازهای اصلی کشور را در حوزه‌های مختلف علوم و فناوری، شناسایی کنید تا تعداد دانشگاه‌ها و دانشجویان، رشته‌های لازم و سطوح این رشته‌ها براساس این نیازها مشخص شود و وزارت علوم و آموزش عالی نیز تنها براساس این اهداف، به توسعه آموزش عالی اقدام کند.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای در بخش دیگری از سخنان خود با اشاره به روزهای آخر ماه مبارک رمضان، تلاش برای بهره‌گیری بیشتر از فضای لطف، رحمت، نورانیت و صفای الهی در این روزهای پایانی را توصیه کردند و افزودند: طهارت و صفای نفس برای همه انسان‌ها مفید است اما برای دانشمندان و استادان، لازم‌تر، مفیدتر و پرسودتر است،
زیرا منش و رفتار استاد در تکوین شخصیت جوان دانشجو بسیار تأثیرگذار است.ایشان از دیگر فواید طهارت نفس و معنویت استاد را تشخیص جهت درست حرکت علمی دانستند.در پایان این دیدار نماز مغرب و عشاء به امامت حضرت آیت‌الله خامنه‌ای اقامه شد و سپس حاضران روزه خود را به همراه رهبر معظم انقلاب اسلامی افطار کردند.