محمدحسين كفراشي با بيان اينكه ثبت‌نام اينترنتي موجب مي‌شود تا جمعيت حداكثري از فرزندان شاهد و ايثارگر در اين مدارس تحصيل كنند به همشهري گفت:« هر سال ۵۰۰ هزار دانش‌آموز متقاضي ورود به پايه‌هاي اول ابتدايي، دوره اول و دوم متوسطه مدارس شاهد هستند درحالي‌كه ظرفيت ما ۱۰۰ تا ۱۱۰هزار نفر است.» اين در حالي است كه مدارس شاهد در سال‌هاي اخير در پي افزايش تقاضا براي تحصيل در اين مدارس، بدون توجه به كيفيت تنها توسعه كمي داشته و تنها نيمي از جمعيت دانش‌آموزي آن به دانش‌آموزان طرح شاهد اختصاص پيدا كرده‌است.كفراشي نيز با تأييد اين موضوع توضيح مي‌دهد:«طي چند سال اخير مدارس شاهد توسعه كمي داشته و 400مدرسه شاهد به تعداد مدارس قبلي اضافه شده كه با توجه به محدوديت‌ها شاهد افت كيفيت و تنزل جايگاه اين مدارس بوديم. براي رفع اين مشكل، تقويت بنيه علمي فرزندان شاهد و ايثارگران و خدمات‌رساني بهتر تعامل بيشتري با بنياد شهيد و امور ايثارگران برقرار كرديم.»
- زمان و نحوه ثبت‌نام
مديركل امور شاهد و ايثارگران وزارت آموزش و پرورش در پاسخ به اين پرسش همشهري كه نحوه ثبت‌نام در مدارس شاهد چگونه است چنين مي‌گويد:« ثبت‌نام دانش‌آموزان كلاس اولي از اول تا 15خرداد صرفا از طريق سامانه به نشاني www.saja.medu.ir انجام مي‌شود و نتايج ثبت‌نام كلاس اولي‌ها نيز پايان خرداد اعلام خواهد شد. ثبت‌نام دانش‌آموزان ورودي پايه هفتم نيز از اول تا 15تير است و تا پايان تير نتيجه ثبت‌نام اعلام مي‌شود.»
به گفته مشاور وزير آموزش و پرورش در ثبت‌نام اينترنتي مدارس شاهد نيازي به اسكن مدارك و دانش‌آموزان نيست و متقاضيان با ارائه كدملي و سري شناسنامه مي‌توانند وارد سامانه شوند. پس از اعلام نتايج ثبت‌نام دانش‌آموز، خانواده‌ها يك هفته تا 10روز فرصت دارند كه مدارك ثبت‌نام را به مدير مدرسه ارائه دهند و ستادي متشكل از مدير مدرسه، نماينده‌اي از بنياد شهيد و امور ايثارگران و آموزش و پرورش مدارك را بررسي كرده و ثبت‌نام پس از اعلام نظر ستاد، قطعي مي‌شود.
همچنين امسال هيچ نامه‌اي براي ثبت‌نام ورودي‌ها به مدارس شاهد داده نمي‌شود و مدارس شاهد حق ثبت نام مكاتبه‌اي ندارند و اگر جاي خالي داشتند فرزندان فرهنگيان، خيرين مدرسه‌ساز، قاريان ممتاز بين‌المللي در اولويت ثبت نام هستند.
شهريه مدارس شاهد براي دوره ابتدايي ۳۰۰ تا ۴۰۰ هزار تومان، دوره اول متوسطه ۳۵۰ تا ۵۵۰ هزار تومان و دوره دوم متوسطه ۴۳۰ تا ۷۰۰ هزار تومان در سال اعلام شده است.كل هزينه فرزندان شهدا، جانبازان بالاي۷۰ درصد و آزادگان را بنياد شهيد تقبل مي‌كند، فرزندان جانبازان ۵۰ تا ۷۰ درصد از تخفيف ۷۵ درصدي و فرزندان جانبازان ۲۵ تا ۵۰ درصد از تخفيف ۴۰ درصدي و فرزندان جانبازان زير ۲۵ درصد از تخفيف ۲۰ درصدي برخوردار خواهند بود.