آغاز فعالیت آزمایشی خبرگزاری مهر به تاریخ ۱۸ اسفندماه ۸۱ برمی‌گردد که اولین خبر با مطلع «به گزارش خبرگزاری مهر» و با تیتر «ورود داروهای کدئین‌دار به کشورهای حوزه خلیج فارس ممنوع است» در نسخه آزمایشی خبرگزاری مهر منتشر شد.
فعالیت آزمایشی خبرگزاری مهر تا اردیبهشت ماه 1382 فقط برای اعضای داخل تحریریه قابل رویت بوده است؛ تا اینکه در ۲۹ اردیبهشت ماه ۸۲ مطابق با ۱۷ ربیع‌الاول سالروز ولادت رسول گرامی اسلام (ص) و امام جعفر صادق (ع)، به صورت آزمایشی بر روی شبکه اینترنت قرار گرفت.
فعالیت خبرگزاری مهر در تیر ماه ۸۲ و همزمان با روز تبلیغ و اطلاع‌رسانی دینی که مصادف با سالروز صدور فرمان امام خمینی (ره) مبنی بر تاسیس سازمان تبلیغات اسلامی در سال ۱۳۶۰ بود، با حضور حجت‌الاسلام والمسلمین سید مهدی خاموشی رئیس سازمان تبلیغات اسلامی و با مدیر عاملی پرویز اسماعیلی رسمیت پیدا کرد.
همزمان با نوروز ۱۳۸۳، خبرگزاری مهر جهت استفاده هر چه سریع‌تر و آسان‌تر مطبوعات کشور، نخستین تلکس خبری فارسی کشور را در شبکه جهانی اینترنت به نام تلکس اینترنتی مهر با آدرس www.mehrnews.ir راه‌اندازی کرد.
خبرگزاری مهر که از آغاز به دو زبان فارسی و انگلیسی اخبار خود را مخابره می‌کرد، بخش عربی را نیز در ۱۴دی ماه همان سال و همزمان با میلاد امام رضا (ع) فعال کرد.
خبرگزاری در برخی شهرهای اروپا، آمریکای جنوبی، ترکیه، شرق آسیا و در برخی کشورهای حاشیه خلیج فارس دارای نمایندگان مرتبط خبری است و چهلمین عضو رسمی اتحادیه خبرگزاری‌های آسیا و اقیانوسیه «اوآنا» نیز است.
دفتر منطقهای خبرگزاری مهر در جنوب شرق آسیا نیز با هدف پوشش مناسب و کامل‌تر اخبار کشورهای «آسه آن» و تقویت روابط و دیپلماسی عمومی کشورمان در شهریور ۸۹ همزمان با هفته دفاع مقدس و با حضور مقامات و رسانه‌های دو کشور در کوالالامپور پایتخت مالزی افتتاح شد.
خبرگزاری مهر همچنین در سال ۲۰۰۹ میزبان سی و یکمین اجلاس هیئت اجرائی اوآنا و پنجمین اجلاس گروه کارشناسی فنی در تهران شد و مبتکر تهیه پرچم اوآنا برای اولین بار بود.
با توجه به حضور بین‌المللی و فعالیت خبرگزاری مهر با شش زبان فارسی، عربی، انگلیسی، ترکی، اردو، آلمانی، بسیاری از رسانه‌های خارجی ضمن اعلام آمادگی برای ایجاد دفاتر نمایندگی در منطقه مورد نظر برای تبادل اخبار و انعکاس وقایع مهم خبری دو کشور، اقدام به امضاء تفاهم‌نامه همکاری با خبرگزاری مهر کرده‌اند.
خبرگزاری‌های جیهان از ترکیه، سانا از سوریه، کیو دو از ژاپن، ای‌پی‌پی از پاکستان، ترند از آذربایجان، شین هوا از چین، آوا از افغانستان، مونتسامه از مغولستان، یونهاپ از کره جنوبی، برناما از مالزی، آنتارا از اندونزی، پی‌تی‌آی از هند، وی‌ان‌ای از ویتنام، پی‌آی‌ان از فیلیپین، پرنسا لاتینا از کوبا، ای‌اف‌ای از اسپانیا و نیوزیانا از زیمبابوه برخی از رسانه‌های مطرح جهان هستند که با «مهر» ارتباط رسانه‌ای فعال دارند.
موسسه خبرگزاری مهر در سال ۱۳۹۰ با ایجاد تغییرات ساختاری، فعالیت‌های خود را در سه معاونت خبر، فناوری اطلاعات و اجرایی و پشتیبانی متمرکز کرد که از این میان معاونت خبر به عنوان اصلی‌ترین حوزه فعالیت خبرگزاری در قالب سه اداره کل اخبار داخلی، اخبار خارجی و استان‌ها به تأمین محتوای خبری می‌پردازد.
خبرگزاری مهر در کنار چارچوب فعالیت رسانه‌ای مرسوم و به منظور ارائه خدمات خبری متناسب با نیازهای مخاطبان عام و در نظر گرفتن علاقمندی‌های نسل جدید، از ابتدای سال ۱۳۹۱ اقدام به راه‌اندازی مجله اینترنتی مهر کرد. «مجله مهر» هم‌اکنون در خروجی مجزایی اقدام به تولید محتوا در حوزه موضوعات متنوع مرتبط با سیاست، جامعه، فرهنگ، چندرسانه ای، طنز و کاریکاتور می‌کند.
علاوه بر مجله مهر، خبرگزاری مهر در قالب 14 سرویس فرهنگ، هنر، دین و اندیشه، حوزه و دانشگاه، دانش و فناوری، سلامت، جامعه، اقتصاد، ورزش، سیاست، بین‌الملل، استان‌ها، عکس و فیلم مشغول فعالیت است. همچنین این خبرگزاری در ۳۱ استان کشور دارای نمایندگی است.
پرویز اسماعیلی (تیر ماه 82 تا مهر ماه 89)، رضا مقدسی (آبان 89 تا اردیبهشت 93) و علی عسگری (14 اردیبهشت 93 تا کنون) مدیران عامل سازمان خبرگزاری مهر تا کنون بوده‌اند.
منبع: خبرگزاری مهر