این گوشی از نظر سخت‌افزار تمام ویژگی‌های آیفون سیکس اس را دارد اما فقط درقالبی کوچک‌تر طراحی شده است. آیفون 5se یکی از طراحی‌های مهم کمپانی اپل در سال 2016 هست و به عبارتی میتوان جزو اولین تکنولوژی‌های سال 2016 باشد.
این طراحی اپل به عبارتی یک برگشت به عقب در طراحی ظاهری گوشی‌های خود است. اپل برای اولین بار با طراحی آیفون 5s اولین گوشی 4 اینچی خود را معرفی کرد. اما این نوآوری از نظر سخت افزاری بسیار متفاوت‌تر از 5 اس است.
همانطور که گفته شد، این گوشی از نظر سخت‌افزاری با آیفون 6 اس تقریبا در یک خط حرکت می‌کند. طبق گزارشات رسیده 5 اس‌ای از همان پردازنده 6 اس برخوردار است. همچنین دوربین بکار رفته در 5se مانند 6 اس می‌باشد.
لنز دوربین 5se دوازده مگاپیکسل با قابلیت دخیره ویدیو با کیفیت 4k است.