ظاهر آیفون SE بسیار نزدیک به آیفون 5 و آیفون 5S است اما از نظر مشخصاتی این‌بار شاهد استفاده از پردازنده A9 اپل هستیم که 2 هسته‌ای بوده و سرعت کلاکش 1.85 گیگاهرتز است، هم‌چنین در این پردازنده از پردازش‌گر گرافیک PowerVR GT7600 استفاده شده که شش هسته پردازشی دارد.
نمایشگر چهار اینچی این گوشی با رزولوشن 1136×640 پیکسل انتخاب شده است که تراکم پیکسلی 326 پیکسل بر هر اینچ را به ارمغان می آورده؛ از دیگر ویژگی‌های این نمایشگر استفاده از رتینا فلش است که موجب می‌شود نمایشگر هنگام گرفتن عکس سلفی سه برابر روشن‌تر از حالت عادی شود، متاسفانه اپل از ویژگی لمس سه‌بعدی در این اسمارت‌فون استفاده نکرده است.
در بخش دوربین آیفون SE هم‌چون دو پرچم‌دار بزرگ سایز آیفون از سنسور 12 مگاپیکسلی iSight بهره‌مند است که توانایی ضبط تصاویر به صورت 4K را نیز داراست، دوربین جلو 1.2 مگاپیکسلی است که تنها ویژگی آن مجهز بودن به رتینا فلش است.
طراحی این آیفون 4 اینچی دقیقا مشابه آیفون 5S است با این تفاوت که این‌بار در کلید هوم از سنسور اسکنر اثر انگشت دقیق‌تر استفاده شده و هم‌چنین برای استفاده از خدمات پرداخت مجهز به سنسور NFC خواهد بود. آیفون SE درست همانند آیفون 5S وزنی 113 گرمی دارد.
شاید بهترین قسمت در مورد آیفون SE قیمت آن باشد؛ این اسمارت‌فون کوچک در قیمت پایه 399 دلار برای نسخه 16 گیگابایتی و نسخه 64 گیگابایتی با قیمت 499 دلار عرضه خواهد شد، البته این گوشی در ایالات متحده با قرارداد دو ساله و اقساط ماهیانه 17 دلار ارایه می‌شود.
پیش فروش آیفون SE از تاریخ 24 مارس آغاز می‌شود و عرضه رسمی آن در 31 مارس اتفاق خواهد افتاد؛ این اسمارت‌فون در 4 رنگ از جمله رنگ محبوب این روزها یعنی رزگلد ارایه خواهد شد.