جمهوری اسلامی، پیشرفت و عزت اندونزی به‌عنوان کشوری مسلمان و پرجمعیت را مایه‌ی افتخار و عزت امت اسلامی می‌داند.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، نگاه جمهوری اسلامی به اندونزی را نگاهی بر اساس برادری و همکاری دانستند و با اشاره به پیشرفت‌های خوب این کشور در بخش‌های گوناگون، افزودند: جمهوری اسلامی ایران نیز ظرفیت‌های زیادی در بخش‌های مختلف اقتصادی و منابع زیرزمینی و معدنی دارد و معتقدیم کشورهای اسلامی باید برخلاف خواست دشمنان، یکدیگر را تقویت و از اختلاف پرهیز کنند.
رهبر انقلاب اسلامی، سطح پایین مبادلات اقتصادی ایران و اندونزی را شایسته و درخور ظرفیت‌های متعدد دو کشور ندانستند و تأکید کردند: باید با تعیین مراحل زمانی، سطح مبادلات اقتصادی را به ارقامی مانند ۲۰ میلیارد دلار ارتقا داد.
ایشان با اشاره به توافق‌ها و قراردادهای منعقدشده میان دو کشور تأکید کردند: باید تلاش شود که این توافقات به اقدام و عمل تبدیل شود، البته این همکاری‌ها، مخالفانی دارد ولی ما باید با جدیت و اراده‌ی قوی بر آنها غلبه کنیم.
رهبر انقلاب اسلامی، ارتباط و تعامل علمای ایران و اندونزی را نیز مبارک و موجب شکل‌گیری همکاری‌های مستمر دو کشور دانستند.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای در ادامه، درگیری‌های موجود در منطقه‌ی غرب آسیا را تحمیلی و بر اساس اهداف خباثت‌آمیز بیرونی دانستند و با تمجید از مواضع اندونزی در قبال مسئله‌ی فلسطین، افزودند: بسیاری از این بحران‌ها با هدف فراموش شدن سخت‌ترین بحران منطقه و مسئله‌ی اصلی دنیای اسلام یعنی فلسطین به‌وجود آمده است، در حالی که نباید اجازه داد این موضوع فراموش شود.
رهبر انقلاب اسلامی همچنین با تجلیل از شخصیت برجسته‌ی سوکارنو و نقش‌آفرینی مهم او در شکل‌دهی کنفرانس باندونگ که پایه‌ی اصلی تشکیل نهضت عدم تعهد شد، خاطرنشان کردند: امروز نیز مواضع سیاسی اندونزی و جمهوری اسلامی ایران در مجامع بین‌المللی به یکدیگر نزدیک است.
ایشان همچنین با اشاره به زلزله‌ی اخیر در اندونزی برای درگذشتگان این حادثه از درگاه الهی رحمت و مغفرت و برای بازماندگان آنان صبر و آرامش مسئلت کردند.
در این دیدار که آقای روحانی رئیس جمهوری نیز حضور داشت، آقای «جوکو ویدودو» رئیس جمهوری اندونزی ضمن بیان علاقه‌مندی مردم اندونزی به جمهوری اسلامی ایران، هدف اصلی از سفر خود را توسعه‌ی روابط اقتصادی به‌ویژه در حوزه‌ی انرژی بیان کرد و گفت: مذاکرات سازنده‌ای با دولت ایران داشتیم و مقرر شد ضمن همکاری در بخش گاز و پالایشگاه، شرکت‌های ایرانی ازجمله شرکت مپنا در زمینه‌ی احداث نیروگاه برق در اندونزی نیز سرمایه‌گذاری کنند.
آقای ویدودو با اشاره به اینکه این همکاری‌ها فصل جدیدی از روابط دو کشور را رقم خواهد زد، افزود: این سطح از روابط اقتصادی میان دو کشور شایسته‌ی دو کشور بزرگ اسلامی نیست و رسیدن به مرز مبادلات ۲۰ میلیارد دلاری، موضوعی دست‌یافتنی است.
رئیس‌جمهور اندونزی علاوه بر انرژی، سایر حوزه‌ها از قبیل گردشگری و تبادلات علمی و دانشگاهی را از موضوعات مورد علاقه برای همکاری دانست و با ابراز تأسف از بی‌ثباتی و بحران‌های ایجادشده در منطقه تأکید کرد: اعتقاد داریم اگر کشورهای مسلمان، متحد باشند، به یک قدرت اقتصادی بزرگ و اثرگذار تبدیل خواهند شد.
آقای ویدودو همچنین درخصوص مسئله‌ی فلسطین تأکید کرد: اندونزی خود را متعهد به موضوع فلسطین می‌داند و ما در حمایت از حقوق مردم فلسطین جدی و فعال هستیم.