این خبرگزاری با حمایت جهاد دانشگاهی فعالیت می‌کند. بدنه اصلی نیروی کار ایسنا را دانشجویان تشکیل می‌دهند. ایسنا در خارج از ایران دفتر خبری ندارد ولی دانشجویان خارج از کشور اخباری را برای این خبرگزاری ارسال میکنند.
شبکه اولیه ایسنا به صورت workgroup با توپولوژی شبکه bus و جمعا با 8 ایستگاه کاری در قالب 2 سرور و 6 دستگاه کاربر طراحی شده بود.
در طول 4 ماه اول کار ایسنا چند اتفاق مهم فنی رخ داد:
1. اضافه شدن تسیستم‌ها از 6 ایستگاه کاری به 9 ایستگاه کاری
2. ارتقای شبکه داخلی ایسنا از bus به Star با سرعت 10 Mbps
اما در تیرماه سال 81 بود که پس از چندین ماه تحقیق در خصوص سرورهای اختصاصی، سرور اختصاصی ایسنا تهیه شد و 1000 مگابایت اطلاعات معادل 8100 عکس به همراه بانک اطلاعات ایسنا و دیگر نرم افزارهای ویژه ایسنا بر روی سرور حدید ارسال شد و در حدود شهریور ماه سال 1381 نسخه اینترانتی سایت ایسنا با نسخه اینترنتی آن یکسان شد. یک سال بعد یعنی در تیرماه سال 1382 با تغییر در DNS نام isna.ir به سایت اینترنتی منتقل شد
دکتر ابوالفضل فاتح مؤسس و نخستین مدیر عامل خبرگزاری دانشجویان ایران درباره این خبرگزاری گفته است: ایسنا نمادی از رمز و راز ماندگاری، هوشمندی و ایمان نسل جوان ایرانی است که بذر پاکی و صداقت می‌افشاند.