مبنای این رتبه‌بندی گردآوری و تجزیه و تحلیل اطلاعات یک درصد مقالات دارای بیشترین استنادات در پایگاه ISI Web of Sciences در فاصله ۱۰ سال و هشت ماه ژانویه ۲۰۰۷ تا پایان آگوست ۲۰۱۷ بوده که اطلاعات آن هر دوماه یکبار روزآمد می‌شود.
از ایران، در حال حاضر ۱۶ دانشگاه و موسسه علوم پزشکی کشور در این نظام رتبه‌بندی واجد رتبه هستند که در ویرایش اخیر، دانشگاه‌های علوم پزشکی کرمانشاه، جندی شاپور اهواز و اراک برای اولین بار در این نظام رتبه‌بندی وارد و حائز رتبه شده‌اند.
مرکز توسعه و هماهنگی انتشارات علمی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي، اطلاعات این دانشگاه‌ها را در سه جدول اعلام کرده است.
جدول ۱: رتبه دانشگاه‌ها و موسسات علوم پزشکی کشور بر اساس تعداد استنادات مقالات پُراستناد
| ردیف | دانشگاه علوم پزشکی/ موسسه | رتبه در گروه موضوعی | ||||||||
| رتبه کل | Clinical Medicine | Pharmacology & Toxicology | Chemistry | Social Sciences | Neuroscience & Behavior | Immunology | Agricultural Sciences | Biology & Biochemistry | ||
| ۱ | تهران | ۷۰۶ | ۴۱۸ | ۱۳۷ | ۶۷۷ | ۴۴۷ | ۶۲۲ | ۴۷۰ | ۷۲۵ | ۸۴۵ |
| ۲ | شهید بهشتی | ۱۴۷۳ | ۹۲۸ | ۵۲۷ | - | ۱۱۲۱ | - | - | ۶۲۵ | - |
| ۳ | اصفهان | ۲۰۹۶ | ۱۱۳۰ | - | - | ۹۹۲ | - | - | - | - |
| ۴ | مشهد | ۲۱۳۶ | ۱۲۶۸ | ۳۹۱ | - | - | - | - | - | - |
| ۵ | شیراز | ۲۱۸۲ | ۱۲۸۶ | ۷۸۶ | - | - | - | - | - | - |
| ۶ | تبریز | ۲۲۳۲ | ۱۶۸۰ | ۴۹۸ | - | - | - | - | - | - |
| ۷ | انستیتو پاستور | ۲۷۳۷ | ۲۹۶۷ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۸ | ایران | ۲۹۶۹ | ۱۶۷۳ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۹ | کرمان | ۳۳۸۰ | ۲۵۳۳ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۰ | مازندران | ۳۳۹۳ | ۲۳۷۰ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۱ | بقیه الله (عج) | ۳۷۹۵ | ۲۶۹۵ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۲ | کردستان | ۳۹۰۴ | ۱۹۷۸ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۳ | کرمانشاه | ۳۹۹۰ | ۴۰۲۲ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۴ | اهواز | ۴۳۰۹ | ۴۰۲۰ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۵ | زاهدان | ۴۶۲۸ | ۳۷۴۶ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۶ | اراک | ۵۵۹۵ | ۳۹۶۹ | - | - | - | - | - | - | - |
جدول ۲: رتبه دانشگاه‌ها و موسسات علوم پزشکی کشور براساس تعداد مقالات پُراستناد
| ردیف | دانشگاه علوم پزشکی/ موسسه | رتبه در گروه موضوعی | ||||||||
| رتبه کل | Clinical Medicine | Pharmacology & Toxicology | Chemistry | Social Sciences | Neuroscience & Behavior | Immunology | Agricultural Sciences | Biology & Biochemistry | ||
| ۱ | تهران | ۳۸۵ | ۱۶۵ | ۲۵ | ۶۷۴ | ۲۹۵ | ۳۲۰ | ۱۶۷ | ۶۰۴ | ۴۴۲ |
| ۲ | شهید بهشتی | ۸۶۶ | ۴۲۱ | ۱۴۸ | - | ۷۷۲ | - | - | ۶۲۵ | - |
| ۳ | شیراز | ۱۲۸۸ | ۵۹۴ | ۵۲۰ | - | - | - | - | - | - |
| ۴ | تبریز | ۱۳۷۱ | ۷۶۵ | ۲۳۹ | - | - | - | - | - | - |
| ۵ | اصفهان | ۱۳۷۹ | ۵۸۷ | ۲۹۵ | - | ۱۱۲۳ | - | - | - | - |
| ۶ | مشهد | ۱۴۵۹ | ۷۲۳ | ۱۴۹ | - | - | - | - | - | - |
| ۷ | ایران | ۱۶۵۱ | ۷۳۴ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۸ | انستیتو پاستور | ۲۲۵۵ | ۱۸۲۴ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۹ | کرمان | ۲۴۷۸ | ۱۴۶۱ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۰ | بقیه الله (عج) | ۲۵۷۱ | ۱۴۲۰ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۱ | کرمانشاه | ۲۷۶۱ | ۱۸۶۰ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۲ | اهواز | ۲۷۶۸ | ۱۷۱۶ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۳ | مازندران | ۲۸۲۰ | ۱۷۷۳ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۴ | زاهدان | ۳۴۶۶ | ۱۸۸۳ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۵ | کردستان | ۳۶۸۳ | ۲۶۰۸ | - | - | - | - | - | - | - |
| ۱۶ | اراک | ۵۵۶۶ | ۴۰۴۳ | - | - | - | - | - | - | - |
جدول ۳: اطلاعات کلی دانشگاه‌ها و مؤسسات علوم پزشکی کشور مرتب شده بر اساس تعداد کل استنادات
| ردیف | نام دانشگاه | تعداد کل مقالات | تعداد کل استنادات | متوسط تعداد استناد به ازای مقاله | تعداد مقالات پراستناد |
| ۱ | دانشگاه علوم پزشکی تهران | ۱۹۲۸۵ | ۱۵۳۸۲۷ | ۷.۹۸ | ۱۰۹ |
| ۲ | دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی | ۸۳۳۸ | ۵۴۰۴۶ | ۶.۴۸ | ۳۹ |
| ۳ | دانشگاه علوم پزشکی اصفهان | ۴۵۶۶ | ۳۰۵۴۸ | ۶.۶۹ | ۲۷ |
| ۴ | دانشگاه علوم پزشکی مشهد | ۴۲۵۸ | ۲۹۵۰۷ | ۶.۹۳ | ۵۲ |
| ۵ | دانشگاه علوم پزشکی شیراز | ۴۹۵۸ | ۲۸۶۰۱ | ۵.۷۷ | ۹ |
| ۶ | دانشگاه علوم پزشکی تبریز | ۴۵۹۱ | ۲۷۷۶۵ | ۶.۰۵ | ۲۱ |
| ۷ | انستیتو پاستور | ۲۱۸۳ | ۱۹۰۹۴ | ۸.۵۷ | ۱۰ |
| ۸ | دانشگاه علوم پزشکی ایران | ۳۵۲۸ | ۱۵۹۸۶ | ۴.۵۳ | ۱۹ |
| ۹ | دانشگاه علوم پزشکی کرمان | ۱۸۱۵ | ۱۱۹۵۰ | ۶.۵۸ | ۱۰ |
| ۱۰ | دانشگاه علوم پزشکی مازندران | ۱۳۸۳ | ۱۱۷۵۷ | ۸.۵۰ | ۱۷ |
| ۱۱ | دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج) | ۱۶۷۱ | ۸۹۱۱ | ۵.۳۳ | ۲۶ |
| ۱۲ | دانشگاه علوم پزشکی کردستان | ۶۰۹ | ۸۳۱۱ | ۱۳.۶۵ | ۱۷ |
| ۱۳ | دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه | ۱۴۵۲ | ۷۷۰۲ | ۵.۳۰ | ۵ |
| ۱۴ | دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز | ۱۴۳۶ | ۵۹۸۶ | ۴.۱۷ | ۱۴ |
| ۱۵ | دانشگاه علوم پزشکی زاهدان | ۷۶۲ | ۴۶۷۴ | ۶.۱۳ | ۳ |
| ۱۶ | دانشگاه علوم پزشکی اراک | ۴ | ۲۱۰۵ | ۵۲۶.۲۵ | ۴ |