به گزارش گروه دریافت خبر خبرگزاری دانشجویان ایران(ایسنا)، متن پیام حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به این کنگره به این شرح است:
بسمه‌تعالی
سلام بر شما جوانان عزیز
امیدواریم این گردهمایی، شما را به بصیرت و صبر که نیاز جوان دانش‌ور امروز است، هرچه نزدیکتر کند. از این فرصت‌ها و از فرصت جوانی برای اعتلای معنوی و فکری بهره بگیرید. کشور شما به نسل جوان مومن و اندیش‌مند و پر‌انگیزه، از همه چیز و از همیشه بیش‌تر نیازمند است.
همه شما را به خدای حکیم و علیم می‌سپارم.
والسلام علیکم و رحمه‌الله
سیدعلی خامنه‌ای