همين موضوع موجب شده است تا كاشي‌هاي صفوي اين مسجد تاريخي در مرمت ديوارها از جاي خود خارج شوند و به جاي آنها كاشي‌هاي جعلي گذاشته شود. اين خبر را همسايگان مسجد تاريخي حكيم اصفهان در نامه‌اي به خبرگزاري ميراث فرهنگي اعلام كرده‌اند.
براساس اين خبر، مسجد حكيم اصفهان در انتهاي بازار رنگرزان اصفهان واقع شده كه بناي آن مربوط به دوره شاه عباس دوم است. حكيم محمد داوود پزشك شاه عباس دوم اين مسجد را بر ويرانه‌هاي مسجد جامع ديلمي جورجير يا مسجد صاحب اسماعيل‌بن‌عباد در قرن چهارم هجري بنا كرد.
كتيبه‌ها، سردرها و ايوان‌هاي داخل اين مسجد نيز در سال‌هاي 1067تا 1073 هجري قمري ايجاد شده است.اما همسايگان مسجد تاريخي حكيم اصفهان در نامه خود از شيوه مرمت اين مسجد ابراز نگراني كرده و اعلام كرده‌اند كه كاشي‌هاي اصيل اين مسجد تاريخي از داخل بنا بيرون كشيده مي‌شود و به جاي آن كاشي‌هاي جعلي كار گذاشته مي‌شود.آنطور كه اهالي محله اعلام كرده‌اند، ستون‌ها و كاشي‌هاي مسجد حكيم اصفهان سال‌ها قبل مرمت شده‌اند اما درحال‌حاضر اين كاشي‌ها كه نقص ندارند برداشته و كاشي‌هاي جعلي به جاي آن گذاشته مي‌شود.
فريدون اللهياري، رئيس اداره ميراث‌فرهنگي اصفهان اما از اين موضوع ابراز بي‌اطلاعي كرده و به خبرگزاري ميراث فرهنگي گفته است: مرمت ستون‌ها و كاشي‌هاي مسجد حكيم در اختيار ميراث‌فرهنگي نيست. به گفته او، ميراث‌فرهنگي تنها مرمت پشت‌بام مسجد حكيم را برعهده دارد و هيچ اطلاعي از مرمت‌هاي ستون‌ها و كاشي‌ها ندارد. ناصر طاهري، معاون ميراث‌فرهنگي اصفهان نيز گفته است، مدت‌هاست كه ميراث‌فرهنگي نظارتي بر مسجد حكيم اصفهان و مرمت ستون‌ها و كاشي‌هاي آن ندارد.به گفته او، مرمت مسجد حكيم توسط هيأت امنا و بدون نظارت كارشناسان ميراث‌فرهنگي انجام مي‌شود و اداره ميراث‌فرهنگي اصفهان تنها موظف به مرمت پشت‌بام مسجد است.