قدمت بنای این بقعه به دوران سلجوقیان می‌رسد. این مکان دارای صحن وسیع، مسجد، ایوان، رواق، ضریح، حرم آینه کاری، سرداب، گنبد کاشی مخروطی‌شکل و همچنین سقاخانه است. سال ۱۳۱۸ ه. ش. بنای امامزاده یحیی(ع) و صحن آن به‌طور کلی تخریب شد، اما مرقد زیارتگاه که در عمق ۴ متری زمین و در یک سرداب قرار داشت، حفظ شد.
در سال ۱۳۲۰ بنای جدید امامزاده بر اساس نقشه برج قدیمی و با همان ابعاد دوباره‌سازی و مرمت شد. بیشتر نوستالژی و خاطره مشترک مردم طهران قدیم و همسایه‌های ما در این منطقه، وجود چنار ۸۰۰ ساله، داخل حیاط این امامزاده است.
در سال ۱۳۳۰ درختی با قطر ۷متر که چنار در فهرست آثار ملی به‌عنوان کهنسال‌ترین و قدیمی‌ترین درخت چنار از سوی اداره باستان‌شناسی با شماره ۳، به ثبت رسیده است. اگر قصد گشت‌وگذار در بقعه‌های متبرکه را دارید پیشنهاد می‌کنیم سری به امامزاده یحیی(ع) حوالی خیابان‌های ری و ۱۵ خرداد بزنید.