این دانشگاه دارای 16 رشته دکتری تخصصی، 53 رشته کارشناسی ارشد و64 رشته کارشناسی است.
دانشکده‌ها و گروه‌های دانشگاه یزد به شرح زیر است:
دانشکده اقتصاد، مدیریت و حسابداری
این دانشکده از سال 1369 فعالیت خود را آغاز کرده است و با گرایش‌های مدیریت بازرگانی، مدیریت صنعتی، اقتصاد صنعتی، مدیریت جهانگردی و حسابداری در مقطع کارشناسی و 4 رشته ارشد (مدیریت صنعتی، مدیریت بازرگانی، اقتصاد صنعتی و مدیریت اجرایی) در مقطع کارشناسی ارشد فعالیت دارد.
دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر
- گروه مهندسی برق
- گروه مهندسی کامپیوتر
دانشکده ریاضی
این دانشکده از سال 1355 فعالیت خود را آغازکرده است و تشکیل این دانشکده از 15/12/1372 با مصوبه شورای گسترش آموزش عالی به رسمیت شناخته شده است.
دانشکده زبان و ادبیات
این دانشکده شامل 3 گروه آموزشی: زبان و ادبیات فارسی، زبان و ادبیات عربی، زبان و ادبیات انگلیسی در 3 مقطع کارشناسی به فعالیت آموزشی خود ادامه می‌دهد.
دانشکده علوم اجتماعی
این دانشکده از سال 1374 فعالیت خود را آغاز کرده است و از مهرماه 1375 با پذیرش دانشجو به فعالیت خود ادامه داده است. دارای سه رشته تحصیلی و 9 عضو هیات علمی، دو رشته تعاون و رفاه اجتماعی و مردم‌شناسی در مقطع کارشناسی و رشته جامعه‌شناسی در مقطع کارشناسی‌ارشد است.
- گروه کتابدرای و اطلاع رسانی
دانشکده علوم انسانی
- گروه تاریخ
- گروه علوم سیاسی
- گروه جغرافیا
- گروه علوم تربیتی
- گروه تربیت بدنی و علوم ورزشی
- گروه معارف اسلامی
- گروه فقه و مبانی حقوق اسلامی
دانشکده علوم پایه
این دانشکده در سه گروه شیمی، زمین‌شناسی و زیست‌شناسی و 3 رشته تحصیلی در دوره‌های کارشناسی، 7 گرایش کارشناسی و دکترا به فعالیت آموزشی خود ادامه می‌دهد.
- گروه شیمی
- گروه زیست‌شناسی
- گروه زمین‌شناسی
دانشکده فنی مهندسی
این دانشکده در 4 گروه و 7 رشته و گرایش کارشناسی، 8 رشته و گرایش کارشناسی ارشد و 2 رشته دکترا به فعالیت آموزشی خود ادامه می‌دهد.
- گروه مهندسی صنایع
- گروه مهندسی عمران
- گروه مهندسی مکانیک
- گروه مهندسی نساجی
دانشکده فیزیک
این دانشکده از سال 1364 فعالیت خود را آغاز کرده است و دارای 17 عضو هیأت علمی رسمی، 346 دانشجوی رشته فیزیک با‌گرایش‌های: کاربردی، اتمی و مولکولی، هسته‌ای و حالت جامد در مقطع کارشناسی ، 73دانشجوی کارشناسی ارشد با گرایش‌های اتمی مولکولی، حالت جامد و هسته‌ای و ذرات بنیادی و هواشناسی و 1 دانشجوی دکترا در گرایش اتمی مولکولی است.
دانشکده مهندسی معدن و متالورژی
شورای گسترش آموزش عالی در تاریخ 25/4/84 موافقت قطعی خود را با ایجاد دانشکده مهندسی معدن و متالورژی در دانشگاه یزد اعلام کرود.
- گروه مهندسی اکتشاف معدن
- گروه مهندسی استخراج معدن
- گروه مهندسی متالورژی
دانشکده منابع طبیعی وکویرشناسی یزد
این دانشکده از سال1371 فعالیت خود را آغاز کرده است و در رشته‌های مهندسی منابع‌طبیعی، گرایش‌های مرتع و آبخیزداری، محیط زیست و مدیریت بیابان فعالیت دارد.
- مرکز بین المللی همزیستی با کویر
دانشکـده منـابع طبیعی وکویرشناسی اردکان
این دانشکده از سال 1374 فعالیت خود را آغاز کرده و با گرایش مهندسی منابع طبیعی ـ مرتع و آبخیزداری و مهندسی منابع طبیعی ـ محیط زیست در مقطع کارشناسی ناپیوسته در دو گروه آموزشی فعالیت می‌کند.
دانشکده هنر و معماری
این دانشکده در یک مجموعه ساختمان‌های قدیمی که با حفظ اصالت هنری و معماری آن بازسازی شده است قرار گرفته و در 3 گروه با 3 رشته تحصیلی به فعالیت آموزشی خود ادامه می‌دهد.
- گروه شهرسازی
- گروه معماری
- گروه نقاشی
مرکز آموزش عالی آیت الله حایری میبد
این دانشکده از سال 1374 فعالیت خود را آغاز کرده است و در دو گرایش(علوم قرآن و حدیث) و(فقه وحقوق اسلامی) فعالیت دارد.
منبع مورد استفاده برای این مدخل