وی سال‌ها در حوزه تئاتر عروسکی مشغول نگارش، ترجمه و کارگردانی بود.
از جمله فعالیت‌های او می‌توان به نمایش‌های علی‌بابا و چهل دزد بغداد، دوستان الماس، بز زنگوله پا، کدو قلقله زن، سیاوش، فرنگیس، خرمشیر اشاره کرد.
ذوالفقاری همواره متون و داستان‌های کهن ایرانی را دستمایه خلق آثار خود قرار می‌داد. وی نمایش بازی پسر و گرگ را در رپرتوار کودک و نوجوان سازمان فرهنگی هنری شهرداری تهران اجرا کرد.
جواد ذوالفقاری از فعالان تئاتر عروسکی، نویسنده، کارگردان، مترجم و مدرس دانشگاه مدتی از سرطان کبد رنج برد و اردیبهشت سال 1390 در خانه‌اش درگذشت.