وی دارای دیپلم تدوین فیلم از مدرسه عالی سینما و تلویزیون است و فعالیت هنری‌اش را با ساخت فیلم‌های کوتاه آغاز کرد.
افخمی پس از ساخت چند فیلم مستند در تلویزیون، فعالیت در سینمای حرفه‌ای را با فیلم «زیر باران» به کارگردانی سیف الله داد به عنوان مدیر فیلمبرداری آغاز کرد.
در سال 1364 و در پی انصراف ناصر تقوایی از ساخت مجموعه تلویزیونی «کوچک جنگلی» کارگردانی آن را به عهده گرفت.
وی با کارگردانی فیلم عروس دیپلم افتخار بهترین کارگردانی را از نهمین جشنواره فیلم فجر دریافت کرد.
از دیگر فعالیت‌های جنبی وی می‌توان به تدریس سینما، عضویت در شورای هنرستان روایت فتح و نماینده مردم در ششمین دوره مجلس شورای اسلامی اشاره کرد.
مرجان شیرمحمدی؛ بازیگر سینما و نویسنده، همسر بهروز افخمی است.
برخی از آثار بهروز افخمی:
- روباه (۱۳۹۳)
- آذر، شهدخت، پرویز و دیگران (۱۳۹۲)
- این خانه من نیست (۱۳۸۹)
- سن پترزبورگ (۱۳۸۸)
- عملیات ۱۲۵ (۱۳۸۸)
- شوکران (۱۳۷۷)
- جهان پهلوان تختی (۱۳۷۶)
- عقرب (۱۳۷۵)
- گاوخونی (۱۳۸۱)
- فرزند صبح (۱۳۸۷-۱۳۸۴)
- روز شیطان (۱۳۷۳)
- روز فرشته (۱۳۷۲)
- عروس (۱۳۶۹)
- تفنگ‌های سحرگاه (۱۳۶۷)
- سریال کوچک جنگلی (۱۳۶۶)
جشنواره‌ها:
برنده سیمرغ بلورین بهترین فیلم از سی و دومین دوره جشنواره فیلم فجر برای فیلم آذر، شهدخت، پرویز و دیگران
برنده سیمرغ بلورین بهترین فیلمنامه از سی و دومین دوره جشنواره فیلم فجر برای فیلم آذر، شهدخت، پرویز و دیگران
برنده جایزه هیئت داوران بهترین کارگردانی از بیست و دومین دوره جشنواره فیلم فجر برای فیلم گاوخونی
برنده تندیس زرین بهترین فیلمنامه از دومین دوره جشن خانه سینما برای فیلم جهان پهلوان تختی
برنده دیپلم افتخار بهترین کارگردانی از نهمین دوره جشنواره فیلم فجر برای فیلم عروس