پس از پیروزی انقلاب، فعالیت‌های مرکز پزشکی ایران در طول سال‌های ۱۳۶۳-۱۳۶۱ به طور محدود تداوم و نهایتاً با سپری شدن دوره کوتاه فترت و تصویب تأسیس دانشگاه‌های علوم پزشکی تحت پوشش وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در سال ۱۳۶۵ از ادغام چند دانشکده و موسسه آموزش عالی در مرکز پزشکی رسماً تحت عنوان دانشگاه علوم پزشکی ایران فعالیت خود را ادامه داد.
وب‌سایت: iums.ac.ir
این دانشگاه در آبان ۱۳۸۹ با دانشگاه علوم پزشکی تهران ادغام شد و پس از گذشت دو سال و پنج ماه از این انحلال در تاریخ ۱۸ فروردین ۱۳۹۲ با تصویب شورای عالی گسترش دانشگاه‌ها این دانشگاه دوباره احیا شد.
دانشگاه علوم پزشکی ایران در زمان ادغام، چهارمین دانشگاه برتر علوم پزشکی کشور بوده‌است.