او در سال ۱۹۷۷ وارد ارتش مصر شد و در دوازدهم اگوست ۲۰۱۲ توسط محمد مرسی به سمت وزارت دفاع مصر گمارده و جانشین سپهبد طنطاوی شد.
السیسی پیش از رسیدن به کرسی وزارت دفاع مصر در دولت هشام قندیل مدیر واحد اطلاعات نظامی در ارتش بود.
او مدرک کارشناسی خود را در رشته علوم نظامی از دانشگاه ارتش در قاهره گرفته و برای ادامه تحصیل به انگلستان سفر کرده و در سال ۱۹۹۲ موفق به کسب درجه کارشناسی ارشد در رشته علوم نظامی در این کشور شده است.
ژنرال السیسی علاوه بر تحصیل در انگلیس به آمریکا نیز سفر کرده و در آنجا آموزشهای ویژه اطلاعاتی دیده است.
نیروهای مسلح مصر به سرکردگی السیسی در اول جولای ۲۰۱۳ به محمد مرسی رئیس جمهور مصر برای حل بحران سیاسی این کشور ۴۸ ساعت فرصت دادند و پس از این اولتیماتوم او را برکنار و عدلی محمود منصور را به عنوان رئیس دولت به جایش نشاندند.
او در فروردین ۱۳۹۳ از سمت وزارت دفاع مصر استعفا داد.
عبدالفتاح سیسی سوم ژوئن ۲۰۱۴ رئیسجمهوری مصر شد.