متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به شرح زیر است:
بسمالله الرحمن الرحیم
درگذشت روحانی مُصلح و فاضل، جناب ماموستا حسامالدین مجتهدی از علمای برجستهی شافعی و نمایندهی مجلس خبرگان رهبری و امام جمعهی اهل سنت سنندج رحمةاللهعلیه را به عموم مردم مومن و انقلابی کردستان و خانواده و بازماندگان محترم ایشان تسلیت عرض میکنم.
این شخصیت خدوم و کهنسال که بسیاری از علمای منطقه شاگردان وی به شمار میرفتند، از جملهی وفاداران به پیام انقلابی اتحاد مسلمانان بوده و با روحیّهی تقریب میان فِرَق اسلامی، به وظایف روحانی اشتغال داشت.
رحمت و مغفرت حق متعال را برای ایشان مسألت میکنم.
سیدعلی خامنهای
۶ اردیبهشت ۱۳۹۳