بر اساس آیین‌نامه اجرایی شیر مدارس جامعه هدف عبارتند از تمام دانش‌آموزان دختر و پسر دوره‌های پیش‌دبستانی، ابتدایی، راهنمایی و متوسطه شبانه‌روزی دولتی (مدارس غیرانتفاعی از شمول طرح خارج هستند)،همچنین مراکز شبانه‌روزی کودکان بی سرپرست تحت پوشش بهزیستی و کارکنان شاغل در واحدهای آموزشی یاد شده تحت پوشش برنامه ملی شیر قرار خواهند گرفت.
بر اساس این گزارش توزیع شیر به 2 صورت متمرکز و غیر متمرکز اجرا می‌شود.
توزیع شیر به صورت مدرسه محور
(غیر متمرکز) اینگونه است که در شهرستان‌های با جمعیت شهری بالاتر از 100 هزار نفر جمعیت (ملاک جمعیت خانوار است) و شهرستان‌های کم‌تر از 100 هزار نفر که در آن‌ها تأمین شیر به صورت مستقیم توسط مدیر آموزشگاه وجود داشته باشد و به عبارت دیگر شیر بسته‌بندی شده را در مراکز عرضه مواد غذایی شهرستان‌های مذکور توزیع شود، پس از تأیید کار گروه استان به صورت مدرسه محور و با عقد قرارداد توسط مدیر آموزشگاه یا نماینده کار گروه استان با کارخانجات یا عامل توزیع شیر انجام می‌پذیرد.
به این صورت که مدارس از طریق افتتاح حساب جاری مهر نزد نزدیک‌ترین شعبه بانک کشاورزی اقدام کرده و پس از دریافت شیر از پیمانکار و تایید فرم مورد نظر توسط مدیر مدرسه، وجه شیر از حساب مدرسه کسر و مستقیماً توسط بانک عامل به حساب پیمانکار طرف قرارداد واریز می‌شود.
بنابراین گزارش، توزیع شیر به صورت متمرکز نیز اینگونه است که در شهرستان‌هایی که جمعیت شهری آن‌ها کم‌تر از 100 هزار نفر جمعیت و یا شهرستان‌های استان‌های محروم که در مراکز عرضه مواد غذایی آن‌ها شیر توزیع نمی‌شود، به روش متمرکز عمل می‌کنند که در این طرح تأمین و توزیع شیر با عقد قرارداد متمرکز از جانب کارگروه استان با پیمانکار توزیع کننده شیر صورت می‌پذیرد.
این گزارش می‌افزاید: ارکان اجرایی برنامه ملی شیر مدرسه ایران (شما) متشکل از معاون وزیر آموزش و پرورش (مسئول) و نمایندگان تام‌الاختیار وزارتخانه‌های رفاه و تأمین اجتماعی، بازرگانی (سازمان حمایت)، بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و معاونت برنامه‌ریزی و نظارت راهبردی رئیس‌جمهوری و صدا و سیما ست.
اهم وظایف و اختیارات کمیته ملی شیر مدارس شامل سیاست‌گذاری و برنامه‌ریزی برای اجرای برنامه شیر مدرسه در راستای مصوبات مربوطه، تعیین و ابلاغ ضوابط سرانه ریالی دانش‌آموزان، تعیین سرانه ریالی استان‌ها بر اساس تعداد دانش‌آموزان جامعه هدف شاغل به تحصیل و کارکنان مراکز آموزشی مذکور و نظارت بر اجرای برنامه و بررسی گزارش عملکرد ارسالی از کارگروه‌های استانی در قالب سامانه رایانه‌ای موضوع بند 4 مصوبه شورای اقتصاد، بررسی گزارش‌های مختلف به ویژه در خصوص موانع اجرایی، مشکلات و پیشنهاد‌های واصله از کار گروه‌های استانی یا مراجع دیگر و ارائه راه حل مناسب است.
بنابراین گزارش، وظایف دبیرخانه کمیته ملی شیر مدارس شامل اخذ آمار و اطلاعات مربوط به جامعه هدف و ارائه به کمیته ملی شیر مدرسه، ابلاغ سهم اعتبارات هر استان بر اساس سرانه دانش‌آموزی تعیین شده توسط کمیته ملی شیر مدرسه، ارسال چک لیست سهم اعتبارات هر استان توسط ذی‌حسابی به شعبه مرکزی بانک کشاورزی برای واریز سهم اعتبارات هر استان به حساب کارگروه استان، هماهنگی برای تشکیل جلسات کمیته ملی، تدوین متن دستورالعمل‌ها و بخشنامه‌ها برای طرح در کمیته ملی، ابلاغ مصوبات کمیته ملی به دستگاه‌های ذی‌ربط و کارگروه‌های استانی، دریافت گزارش‌ها، بررسی و طرح آن‌ها در جلسات کمیته ملی، انجام مکاتبات لازم با ارگان‌های دولتی و غیردولتی در راستای اجرای برنامه شیر مدرسه، انجام مذاکرات و مکاتبات لازم با کلیه افراد حقیقی و حقوقی در راستای اجرای برنامه و تدوین اطلاعات و گزارش‌های لازم برای ارائه به اعضای کمیته ملی و یا سایر دستگاه‌های ذی‌ربط و ایجاد ارتباط لازم با مجامع بین‌المللی مرتبط و استفاده از تجارب ایشان و تبادل اطلاعات است.
