وی تحصیلات عالی خود را در سال 1354 در رشته پزشکی دانشکده پزشکی دانشگاه تهران آغاز کرد.
وحیددستجردی در سال 1367 موفق به اخذ درجه تخصصی در رشته زنان از دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران شد و به عنوان عضو هیئت علمی گروه زنان و زایمان در بخش زنان و زایمان بیمارستان آرش فعالیت کرد.
مرضیه وحیددستجردی در سال 1388 و توسط محمود احمدی نژاد به عنوان وزیر پیشنهادی دولت برای وزارت بهداشت به مجلس شورای اسلامی معرفی و در روز 12 شهریور همان سال با کسب اکثریت آرا انتخاب شد.
رئیس جمهور محمود احمدی‌ن‍ژاد در روز پنجشنبه هفتم دی‌ماه 91 وی را برکنار کرد.
برخی از سوابق اجرایی مرضیه وحیددستجردی:
- عضو هیئت علمی گروه زنان و زایمان به مدت 13 سال
- مدیرگروه زنان و مامایی دانشگاه تهران به مدت 6 سال
- عضو هیئت ممتحنه و ارزشیابی و بورد تخصصی زنان و مامایی وزارت بهداشت از سال 79-1373
- عضو شورای آموزش پزشکی و تخصصی وزارت بهداشت از سال 75-1372
- عضو هیئت مدیره انجمن تنظیم خانواده از سال 80-1373
- عضو شورای عالی آموزش مداوم جامعه پزشکی کشور از سال 79-1375
- عضو شورای سیاست‌گذاری وزارت بهداشت از سال 75-1373
- عضو شورای برنامه‌ریزی آموزش عالی کشور از سال 78-1371
- نماینده مردم تهران در مجلس شورای اسلامی دوره چهارم و پنجم
- نماینده ریاست دانشگاه در هیئت نظارت بر طرح بیمارستان آرش از سال 79-1373
- عضو گروه پزشکی شورایعالی برنامه‌ریزی از سال 77-1373
- عضو هیات موسس انجمن علمی تخصصی باروری و ناباروری ایران
- عضو شورای عالی نظام پزشکی کشور (79-1375)
- عضو هیات عالی انتظامی نظام پزشکی کشور (79-1375)
- کارشناس زنان و مامایی پزشکی قانونی (79-1368)
- عضو کمیته علمی تنظیم خانواده وزارت بهداشت (76-1373)
- عضو کمیته اخلاق پزشکی در امر پژوهش
