با وجود این، وزارت علوم سیاست مشخصی درباره سروسامان دادن به وضعیت دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالی غیردولتی- غیرانتفاعی ندارد.سال گذشته وزارت علوم ابتدا اعلام کرد مجوز تأسیس دانشگاه غیرانتفاعی صادر نمی‌کند، ولی اواخر سال 91یکباره اعلام کرد که مجوز برای راه‌اندازی دانشگاه غیرانتفاعی صادر می‌کند؛ در نخستین روزهای امسال هم اعلام شده که صدور مجوز بازهم متوقف شده است.
غلامعلی نادری، مدیرکل دفتر آموزش‌های غیرانتفاعی و غیردولتی وزارت علوم در این‌باره به خبرگزاری نسیم اعلام کرد: با توجه به اشباع مؤسسات غیرانتفاعی و غیردولتی در کشور، امسال مجوز جدیدی به این مؤسسات داده نمی‌شود. ظرفیت بسیاری از مؤسسات آموزش عالی غیردولتی طی چند سال اخیر هیچ‌گاه تکمیل نشده است و البته بسیاری از آنها هنوز هیأت امنا ندارند و به لحاظ هیأت علمی نیز مشکلاتی دارند. اکنون یکی از معضلات اساسی مؤسسات آموزش عالی جذب نشدن هیأت علمی با درجه علمی بالاتر به‌دلیل نبود امکانات، همکاری نکردن دولت با اینگونه مؤسسات و کمبود بودجه است.
