این درگیری زمانی آغاز شد که طلاب لعل مسجد، چهار پلیس را که در اطراف این مسجد سیم خاردار می کشیدند، خلع سلاح کردند.
پس از آن شبه نظامیان ارتش پاکستان به داخل مسجد گاز اشکآور پرتاب کرد ، که با تیراندازی طلاب روبرو شد.
دولت پاکستان پیش از این به مسئولان لعل مسجد در خصوص اقدامات غیرقانونی آنان در ربودن شهروندان پاکستانی و اتباع چینی به اتهام فساد اخلاقی ، هشدار داده بود.
چند روز قبل نیز طلاب این مسجد همچنین چند بار ماموران پلیس را گروگان گرفته و آزاد کرده بودند.
در همین حال شبکه تلویزیونی الجزیره گزارش داد ، طلاب این مدرسه ساختمان وزارت محیط زیست و توسعه در نزدیکی مسجد الاحمر را به آتش کشیدند.