رئیس پیشین دانشگاه خواجه‌نصیر‌الدین طوسی که پس از بازگشت از عمره بر کنار شد اشاره‌ای به دلایل برکناری روسای دانشگاه‌ها به نقل از مقامات ارشد وزارت علوم کرد که واکنش وزیر علوم را به‌دنبال داشت.وزیر علوم که توقع رسانه‌ای شدن چنین سخنانی به نقل از رئیس پیشین دانشگاه خواجه نصیر را نداشت بلافاصله اعلام کرد: «هیچ تصمیم کلی برای تغییر روسای دانشگاه‌ها گرفته نشده است و همانگونه که طی یکسال گذشته عمل شده در مواردی به‌صورت جداگانه و بنا به شرایط تغییر یا جابه‌جایی صورت گرفته است.»
البته دکتر بطحایی در واکنش به موج تغییر روسای دانشگاه‌ها گفت: مدیریت دانشگاه‌ها باید علمی باشند، امیدوارم که انتخاب روسای دانشگاه‌ها براساس رابطه نباشد بلکه براساس ضوابط و علمی باشد و نفرات بعدی که ریاست دانشگاه‌ها را بر عهده می‌گیرند قوی‌‌تر از افراد قبلی باشند.
اخیرا روسای دانشگاه‌های دانشگاه صنعتی شیراز، قم، چمران اهواز، علوم و فنون دریایی خرمشهر، تحصیلات تکمیلی کرمان، جیرفت، صنعتی شریف، دانشگاه هنر، زنجان، ایلام، پژوهشگاه پلیمر و پتروشیمی و پژوهشگاه شیمی و مهندسی شیمی ایران با حکم وزیر علوم تغییر کرده‌اند؛ هر چند تنها هدف این تغییرات گسترده در سطح روسای دانشگاه‌های کشور از نظر معاون فرهنگی و اجتماعی وزارت علوم برای «ارتقای کیفی آموزش عالی» است.
البته خواجه‌سروی به نکته جالبی اشاره کرده که «تغییر روسای دانشگاه‌ها در فصل تابستان انجام شده تا در روند فعالیت‌های آموزشی و اجرایی دانشگاه‌ها خللی ایجاد نشود و شاید همین تعویض‌ها در فاصله زمانی کوتاه، این شائبه را برای برخی افراد به‌وجود آورده است که موجی برای تغییر ریاست همه دانشگاه‌ها شکل گرفته، این موضوع به‌هیچ‌وجه، صحت ندارد.»
فارس به نقل از معاون فرهنگی وزیر علوم نوشت: تعدادی از روسای دانشگاه‌ها به‌دلیل کهولت سن، درخواست کنارهگیری از مسئولیت اجرایی کرده‌بودند و تعدادی دیگر نیز تمایل داشتند بیشتر به فعالیت‌های علمی، پژوهشی و آموزشی خود بپردازند.
معاون اداری و مالی وزارت علوم نیز تغییر روسای دانشگاه‌ها را امری طبیعی دانست و گفت: برخی به‌دلیل مسائل علمی و برخی به‌دلیل اتمام دوره 4ساله یا 8 ساله تغییر کرده‌اند و برخی نیز خودشان درخواست کنارهگیری داشته‌اند.
به هر حال موج تغییر روسای دانشگاه‌ها هنوز فروکش نکرده و ادامه دارد و این موج به استان گلستان رسیده و رئیس دانشگاه جامع گلستان نیز تغییر کرد.وزیر علوم، آذر ماه سال 88 درباره تغییر روسای دانشگاه‌ها اعلام کرد: هر جا و هر زمانی به این جمع بندی برسم که نیاز به تغییر باشد، اعمال می‌کنم اما هنوز به این جمع‌بندی نرسیده‌ام. تصمیم من ثبات مدیریت است مگر اینکه ضرورتی وجود داشته باشد.
از تغییرات ایجاد شده در سطح روسای دانشگاه‌ها و سخنان وزیر علوم به این نتیجه می‌رسیم که کامران دانشجو به این جمع‌بندی رسیده که باید روسای دانشگاه‌ها تغییر کنند. اینکه اکنون چه شده که این ضرورت بیش از پیش احساس شده، موضوعی است که باید وزیر علوم به آن پاسخ دهد.البته قرار است موضوع بازنشستگی استادان و تغییر روسای دانشگاه‌ها و انتقال وزارت علوم با حضور وزیر علوم امروز در کمیسیون آموزش مجلس بررسی شود.
