او آهنگسازی و تئوری موسیقی را در دانشگاه مالاگا (در سال 2003 از اسپانیا) فرا گرفت و و همچنین دارای رساله در فلسفه هنر و زیبایی شناسی با موضوع حاشیهای بر فرهنگ شنیداری معاصر ایران - معرفی جریانهای اصلی موسیقی ایران از مشروطه تا انقلاب اسلامی و مقایسه تطبیقی آنها است. تدریس در کنسروانوار تهران 1385 تا 1387 و حضور پیوسته در دانشگاه تهران، دانشکده هنرهای زیبا و دانشگاه آزاد اسلامی، دانشکده هنر و معماری و به عنوان استاد راهنما و داور پایان نامه در مقاطع تحصیلی لیسانس و فوق لیسانس جزو فعالیتهای دیگر وی است.
آثار موسیقایی:
- بچههای زمانه افسوس، برای ارکستر سمفونیک و گروه کر (1383) - سالهای آتش و برف، برای ارکستر سمفونیک (1384)، در فاصله سالهای 1385 تا 1389 نگارش مجموعهای مفصل از کوارتتهایی با ترکیبهای سازی متفاوت، که 5 کوارتت از آنها زیر نام صدای مناظر مخدوش است:
1- چهار تابلو از یک منظره ، کوارتت برای کلارینت سی بمل ، دو ویلن و ویلنسل (1386)
2- سه تابلو از یک منظره ی دیگر، کوارتت زهی (1386)
3- چهار تابلو از یک منظره ی دیگرتر ، کوارتت برای دو کلارینت و دو ویلن ( 1387)
4- منظره بدون قاب ، کوارتت برای چهار ویلن (1389)
5- قاب خالی بدون منظره ، کوارتت سکوت (1389) - همپای باده نوشان (1387 ) کنسرتو برای سه تار و ارکستر زهی - فانتزی برای تار و ارکستر (1389) تقدیم به کیوان ساکت - اجرا ارکستر سمفونیک بوخوم ( آلمان ) - محاسبه ساحت مستور، دوازده دوئت برای ترکیبهای سازی متفاوت (1390)
موسیقیهای متن فیلم:
- رنگین کمان رویا ، کارگردان علی خودسیانی (1385)، همچنین ترانه سرا. تنظیم ترانههای این فیلم برای ارکستر پاپ توسط نیما کامکار انجام شده و موسیقی متن فیلم و کلام ترانههای کودکانه از مانی جعفرزاده است.
- موسیقی تیتراژ مجموعه ی تلویزیونی خواستگاران، کارگردان گلاب آدینه ( 1386) بر مبنای رنگ چهارگاه از علی اکبر شهنازی با اجرای ارکستر زهی پارسیان.
- دماغ، کارگردان فرزاد موتمن (1387)
- ماه در سایه، کارگردان سعید ابراهیمی فر (1387)
- ساعت گیج زمان ، کارگردان فرزاد موتمن (1388)
- غبار عشق ، کارگردان حسینعلی لیالستانی (1388) اجرا شده توسط ارکستر مجلسی کیف ( اکراین)
- راه، کارگردان کاوه سجادی حسینی ( 1388) اجرا شده توسط ارکستر مجلسی کیف ( اکراین )
- ایران بیست سال بعد ، کارگردان سعید ابراهیمی فر ( 1388)
- دشمنان صمیمی (1389) کارگردان اسماعیل میهن دوست
- آوای گمشده (1389) کارگردان سعید ابراهیمی فر
- آتش زیر خاکستر (1389) کارگردان کاوه سجادی حسینی
- یک تیر و دو نشان ( 1389) کارگردان اسماعیل میهن دوست - دو راهی بارانی (1390) محمد قاسمی .
مانی جعفرزاده همچنین دهها یادداشت برای مطبوعات و چندین مقاله علمی برای ارائه در سمینارهای مختلف تخصصی به رشته تحریر در آورده و به عنوان سخنران در بیش از بیست همایش فرهنگی حضور داشته است.
وی همچنین بنیانگذار و عضو گروه فلسفه "روز چهارم" است که با هدف ارتقاء دانش زیبا شناسی و پژوهش در حیطه فلسفه و تاریخ هنر شکل گرفته و جلسات آن به شکل مستمر با حضور نوازندگان ارکستر سمفونیک و دانش جویان موسیقی برگزار میشود.
در اردیبهشت ماه سال 1389 مرور برآثار موسیقایی (غیر سینمایی) مانی جعفرزاده در دنشکده هنر و معماری دانشگاه آزاد اسلامی برگزار شد.