وی سابقه بازی در تیم ملی مکزیک را دارد و در زمان بازیگری در پست دفاع انجام وظیفه می‌کرد.
آگیره سابقه مربیگری در تیمهای باشگاهی اسپانیا از جمله اوساسونا و آتلتیکو مادرید و تیم ملی مکزیک را دارد.
خاویر آگیره در سال 2009 برای دومین بار هدایت تیم ملی مکزیک را برعهده گرفت.
فدراسیون فوتبال مکزیک بعد از کسب نتایج ضعیف، اسون گوران اریکسون را از تیم ملی مکزیک اخراج کرد و هدایت این تیم را بار دیگر به آگیره سپرد.
خاویر آگیره که در جامجهانی 2002 سرمربی تیم ملی مکزیک بود، در سال 2009 و پس از کسب نتایج ضعیف در تیم آتلتیکو مادرید و اخراج از این تیم، سرمربی تیم مکزیک شد.
اریکوسن بعد از 10 ماه کار در تیم ملی مکزیک و شکست 3-1 مقابل هندوراس در مرحله مقدماتی جامجهانی از کار برکنار شد و آگیره جای او را گرفت.
آگیره تیمی متشکل از بازیکنان جوان و با تجربه را در جام جهانی 2010 معرفی کرد.
مکزیک در گروه آ رقابت‌های جام جهانی 2010 با تیمهای اروگوئه، فرانسه و آفریقای جنوبی هم گروه بود.
